gamma-Carotene (BioDeep_00000412500)

Main id: BioDeep_00000004100

 

PANOMIX_OTCML-2023 natural product


代谢物信息卡片


beta,psi-Carotene

化学式: C40H56 (536.4382)
中文名称:
谱图信息: 最多检出来源 () 0%

分子结构信息

SMILES: C1(=C(C)CCCC1(C)C)/C=C/C(/C)=C/C=C/C(/C)=C/C=C/C=C(\C)/C=C/C=C(\C)/C=C/C=C(\C)/CC/C=C(\C)/C
InChI: InChI=1S/C40H56/c1-32(2)18-13-21-35(5)24-15-26-36(6)25-14-22-33(3)19-11-12-20-34(4)23-16-27-37(7)29-30-39-38(8)28-17-31-40(39,9)10/h11-12,14-16,18-20,22-27,29-30H,13,17,21,28,31H2,1-10H3/b12-11+,22-14+,23-16+,26-15+,30-29+,33-19+,34-20+,35-24+,36-25+,37-27+

描述信息

A cyclic carotene obtained by the cyclisation of lycopene.
Window width to select the precursor ion was 3 Da.; CONE_VOLTAGE is 10 V.; This record was created by the financial support of MEXT/JSPS KAKENHI Grant Number 19HP8024 to the Mass Spectrometry Society of Japan.

同义名列表

3 个代谢物同义名

gamma-Carotene; beta,psi-Carotene; gamma-Carotene



数据库引用编号

15 个数据库交叉引用编号

分类词条

177 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有：

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息，我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表，这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序，取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘，得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序，取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中，存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称，可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 4 CAD, NQO1, PARVA, PGP
Peripheral membrane protein 1 PLOD2
Endoplasmic reticulum membrane 2 PLOD1, PLOD2
Nucleus 3 CAD, NQO1, PARVA
cytosol 3 CAD, NQO1, PARVA
dendrite 1 NQO1
phagocytic vesicle 1 STX8
trans-Golgi network 1 STX8
nucleoplasm 1 CAD
Cell membrane 2 KIR2DP1, SLC6A8
lamellipodium 1 PARVA
Multi-pass membrane protein 1 SLC6A8
Synapse 1 NQO1
neuronal cell body 2 CAD, NQO1
Cytoplasm, cytosol 1 NQO1
endosome 1 STX8
plasma membrane 5 CAD, KIR2DP1, PARVA, SLC6A8, STX8
terminal bouton 1 CAD
Membrane 5 CAD, KIR2DP1, NQO1, SLC6A8, STX8
apical plasma membrane 1 SLC6A8
extracellular exosome 3 CAD, PLOD1, PLOD2
Lumenal side 1 PLOD2
endoplasmic reticulum 3 PLOD1, PLOD2, STX8
extracellular space 1 CRP
perinuclear region of cytoplasm 1 STX8
protein-containing complex 1 CAD
Single-pass type I membrane protein 1 KIR2DP1
Secreted 1 CRP
extracellular region 1 CRP
Single-pass membrane protein 1 STX8
actin cytoskeleton 2 CAD, PARVA
Z disc 1 PARVA
nucleolus 1 CAD
Early endosome 1 STX8
recycling endosome 1 STX8
vesicle 1 STX8
Apical cell membrane 1 SLC6A8
Cell junction, focal adhesion 1 PARVA
Cytoplasm, cytoskeleton 2 CAD, PARVA
focal adhesion 1 PARVA
myofibril 1 CAD
Late endosome 1 STX8
chromatin 1 CAD
cell projection 1 CAD
cytoskeleton 1 CAD
Endomembrane system 1 STX8
Cytoplasm, myofibril 1 CAD
Cytoplasm, myofibril, sarcomere, Z line 1 PARVA
stress fiber 1 CAD
SNARE complex 1 STX8
nuclear matrix 1 CAD
actin cap 1 CAD
rough endoplasmic reticulum membrane 2 PLOD1, PLOD2
Single-pass type IV membrane protein 1 STX8
Cytoplasm, cytoskeleton, stress fiber 1 CAD
Rough endoplasmic reticulum 1 PLOD2
catalytic complex 1 PLOD1


文献列表