Tetracenomycin D1 (BioDeep_00000009272)

   

natural product


代谢物信息卡片


Tetracenomycin D1

化学式: C19H12O6 (336.0634)
中文名称:
谱图信息: 最多检出来源 Homo sapiens(plant) 26.66%

分子结构信息

SMILES: CC1=CC(=CC2=CC3=C(C(=C12)O)C(=O)C4=C(C3=O)C=C(C=C4O)O)O
InChI: InChI=1S/C19H12O6/c1-7-2-9(20)3-8-4-11-16(18(24)14(7)8)19(25)15-12(17(11)23)5-10(21)6-13(15)22/h2-6,20-22,24H,1H3

描述信息

同义名列表

1 个代谢物同义名

Tetracenomycin D1



数据库引用编号

12 个数据库交叉引用编号

分类词条

相关代谢途径

Reactome(0)

BioCyc(0)

PlantCyc(0)

代谢反应

0 个相关的代谢反应过程信息。

Reactome(0)

BioCyc(0)

WikiPathways(0)

Plant Reactome(0)

INOH(0)

PlantCyc(0)

COVID-19 Disease Map(0)

PathBank(0)

PharmGKB(0)

17 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有:

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息,我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表,这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序,取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘,得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序,取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中,存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称,可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 6 EGFR, GLA, HDAC1, HDAC2, HDAC3, MED28
Peripheral membrane protein 1 MED28
Endosome membrane 1 EGFR
Endoplasmic reticulum membrane 2 EGFR, GLA
Nucleus 7 ANKRD42, EGFR, HDAC1, HDAC2, HDAC3, MED28, SP9
cytosol 2 HDAC1, HDAC3
nucleoplasm 4 HDAC1, HDAC2, HDAC3, MED28
Cell membrane 2 EGFR, EPHA2
lamellipodium 1 EPHA2
ruffle membrane 2 EGFR, EPHA2
Early endosome membrane 1 EGFR
cell junction 1 EGFR
cell surface 2 EGFR, EPHA2
glutamatergic synapse 1 EGFR
Golgi apparatus 2 GLA, HDAC3
Golgi membrane 1 EGFR
neuronal cell body 1 HDAC1
Cytoplasm, cytosol 1 HDAC3
Lysosome 1 GLA
endosome 1 EGFR
plasma membrane 3 EGFR, EPHA2, HDAC3
Membrane 5 EGFR, EPHA2, GLA, HDAC2, MED28
apical plasma membrane 1 EGFR
basolateral plasma membrane 1 EGFR
extracellular exosome 1 GLA
extracellular space 1 EGFR
lysosomal lumen 1 GLA
perinuclear region of cytoplasm 1 EGFR
protein-containing complex 3 EGFR, HDAC1, HDAC2
ESC/E(Z) complex 1 HDAC2
Single-pass type I membrane protein 2 EGFR, EPHA2
extracellular region 1 GLA
Single-pass membrane protein 1 EPHA2
nuclear membrane 1 EGFR
Cell projection, ruffle membrane 1 EPHA2
heterochromatin 1 HDAC1
Membrane raft 1 EGFR
Cell junction, focal adhesion 1 EPHA2
focal adhesion 2 EGFR, EPHA2
intracellular vesicle 1 EGFR
receptor complex 2 EGFR, EPHA2
chromatin 4 HDAC1, HDAC2, HDAC3, SP9
core mediator complex 1 MED28
mediator complex 1 MED28
mitotic spindle 1 HDAC3
Chromosome 1 HDAC3
chromosome, telomeric region 1 HDAC2
leading edge membrane 1 EPHA2
basal plasma membrane 1 EGFR
synaptic membrane 1 EGFR
transcription repressor complex 2 HDAC1, HDAC3
cortical actin cytoskeleton 1 MED28
histone deacetylase complex 3 HDAC1, HDAC2, HDAC3
tight junction 1 EPHA2
azurophil granule lumen 1 GLA
Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane 1 GLA
NuRD complex 2 HDAC1, HDAC2
clathrin-coated endocytic vesicle membrane 1 EGFR
endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment 1 GLA
Sin3-type complex 2 HDAC1, HDAC2
lamellipodium membrane 1 EPHA2
multivesicular body, internal vesicle lumen 1 EGFR
Shc-EGFR complex 1 EGFR
Cell projection, lamellipodium membrane 1 EPHA2


文献列表

  • Ying-lao Zhang, Shuai Li, Dong-hua Jiang, Li-chun Kong, Ping-hua Zhang, Jia-dong Xu. Antifungal activities of metabolites produced by a termite-associated Streptomyces canus BYB02. Journal of agricultural and food chemistry. 2013 Feb; 61(7):1521-4. doi: 10.1021/jf305210u. [PMID: 23360202]