(2R)-2,3-Dihydroxypropanoic acid (BioDeep_00001868334)

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代谢物信息卡片


(2R)-2,3-Dihydroxypropanoic acid

化学式: C3H6O4 (106.0266)
中文名称: D-甘油酸 钙盐 二水合物, 甘油酸酯, 甘油酸
谱图信息: 最多检出来源 () 0%

分子结构信息

SMILES: C(C(C(=O)O)O)O
InChI: InChI=1S/C3H6O4/c4-1-2(5)3(6)7/h2,4-5H,1H2,(H,6,7)/t2-/m1/s1

描述信息

同义名列表

3 个代谢物同义名

(2R)-2,3-Dihydroxypropanoic acid; D-Glycerate; Glyceric acid



数据库引用编号

15 个数据库交叉引用编号

分类词条

相关代谢途径

Reactome(0)

BioCyc(0)

PlantCyc(0)

代谢反应

0 个相关的代谢反应过程信息。

Reactome(0)

BioCyc(0)

WikiPathways(0)

Plant Reactome(0)

INOH(0)

PlantCyc(0)

COVID-19 Disease Map(0)

PathBank(0)

PharmGKB(0)

41 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有:

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息,我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表,这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序,取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘,得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序,取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中,存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称,可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 10 AKR1B1, CAT, GAPDH, GLYCTK, GRHPR, KHK, PGM2, PGP, PKM, PSPH
Nucleus 3 GAPDH, PKM, PPARA
cytosol 14 AGXT, AKR1B1, BPGM, CAT, GAPDH, GLYCTK, GRHPR, GSR, HAO2, KHK, PGM2, PGM2L1, PKM, PSPH
nucleoplasm 3 AKR1B1, GLDC, PPARA
Golgi apparatus 1 GLYCTK
mitochondrial inner membrane 1 ATP5ME
Cytoplasm, cytosol 4 GAPDH, PGM2, PGM2L1, PSPH
plasma membrane 3 GAPDH, GLDC, HPSE2
Membrane 3 CAT, GAPDH, HPSE2
extracellular exosome 9 AKR1B1, BPGM, CAT, GAPDH, GRHPR, GSR, KHK, PGM2, PKM
extracellular space 3 AKR1B1, CXCL1, HPSE2
perinuclear region of cytoplasm 1 GAPDH
mitochondrion 8 AKR1B1, ATP5ME, CAT, GLDC, GLYCTK, GRHPR, GSR, PKM
protein-containing complex 1 CAT
intracellular membrane-bounded organelle 3 AGXT, CAT, GAPDH
extracellular region 4 CAT, CXCL1, PGM2, PKM
mitochondrial matrix 3 CAT, GLDC, GSR
nuclear membrane 1 GAPDH
external side of plasma membrane 1 GSR
Extracellular vesicle 1 PKM
Secreted, extracellular space, extracellular matrix 1 HPSE2
microtubule cytoskeleton 1 GAPDH
vesicle 2 GAPDH, PKM
Cytoplasm, perinuclear region 1 GAPDH
Cytoplasm, cytoskeleton 1 GAPDH
focal adhesion 1 CAT
extracellular matrix 1 HPSE2
Peroxisome 3 AGXT, CAT, HAO2
Peroxisome matrix 1 CAT
peroxisomal matrix 4 AGXT, CAT, GRHPR, HAO2
peroxisomal membrane 1 CAT
collagen-containing extracellular matrix 1 PKM
cilium 1 PKM
chromatin 1 PPARA
cytoskeleton 1 GAPDH
Lipid droplet 1 GAPDH
[Isoform 1]: Cytoplasm 1 GLYCTK
ficolin-1-rich granule lumen 3 CAT, PGM2, PKM
secretory granule lumen 3 CAT, PGM2, PKM
specific granule lumen 1 CXCL1
tertiary granule lumen 1 CXCL1
ribonucleoprotein complex 1 GAPDH
Rough endoplasmic reticulum 1 PKM
GAIT complex 1 GAPDH
proton-transporting ATP synthase complex 1 ATP5ME
proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o) 1 ATP5ME
catalase complex 1 CAT
catalytic complex 1 GRHPR
[Isoform M2]: Cytoplasm 1 PKM
[Isoform M1]: Cytoplasm 1 PKM
glycine cleavage complex 1 GLDC


文献列表

  • Oliver Fiehn, W Timothy Garvey, John W Newman, Kerry H Lok, Charles L Hoppel, Sean H Adams. Plasma metabolomic profiles reflective of glucose homeostasis in non-diabetic and type 2 diabetic obese African-American women. PloS one. 2010 Dec; 5(12):e15234. doi: 10.1371/journal.pone.0015234. [PMID: 21170321]