Tetracenomycin (BioDeep_00000006350)

 

Secondary id: BioDeep_00001869530


代谢物信息卡片


Tetracenomycin C

化学式: C23H20O11 (472.1006)
中文名称:
谱图信息: 最多检出来源 Homo sapiens(viridiplantae) 1.66%

分子结构信息

SMILES: CC1=C(C(=CC2=CC3=C(C(=C12)O)C(=O)C4(C(=O)C=C(C(C4(C3=O)O)O)OC)O)OC)C(=O)OC
InChI: InChI=1S/C23H20O11/c1-8-14-9(6-11(32-2)15(8)21(29)34-4)5-10-16(17(14)25)20(28)22(30)13(24)7-12(33-3)19(27)23(22,31)18(10)26/h5-7,19,25,27,30-31H,1-4H3/t19-,22-,23-/m1/s1

描述信息

D000890 - Anti-Infective Agents > D000900 - Anti-Bacterial Agents

同义名列表

3 个代谢物同义名

Tetracenomycin C; Tetracenomycin; Tetracenomycin C



数据库引用编号

10 个数据库交叉引用编号

分类词条

相关代谢途径

Reactome(0)

BioCyc(1)

PlantCyc(0)

代谢反应

1 个相关的代谢反应过程信息。

Reactome(0)

BioCyc(1)

WikiPathways(0)

Plant Reactome(0)

INOH(0)

PlantCyc(0)

COVID-19 Disease Map(0)

PathBank(0)

PharmGKB(0)

2 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有:

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息,我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表,这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序,取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘,得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序,取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中,存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称,可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 3 EIF2AK2, FASN, GLA
Peripheral membrane protein 2 GBA1, HSD17B6
Endoplasmic reticulum membrane 3 CYP19A1, GLA, SLC37A4
Nucleus 4 ANKRD42, CYCS, EIF2AK2, ZNF79
cytosol 5 CYCS, EIF2AK2, FASN, LIPE, OXSM
trans-Golgi network 1 GBA1
nucleoplasm 1 EIF2AK2
Cell membrane 1 LIPE
Early endosome membrane 1 HSD17B6
Multi-pass membrane protein 3 CYP19A1, SLC37A4, TPRA1
Golgi apparatus 3 FASN, GBA1, GLA
Golgi membrane 1 INS
lysosomal membrane 1 GBA1
mitochondrial inner membrane 1 CYCS
Cytoplasm, cytosol 1 LIPE
Lysosome 2 GBA1, GLA
plasma membrane 2 FASN, TPRA1
Membrane 7 CYP19A1, EIF2AK2, FASN, GLA, LIPE, SLC37A4, TPRA1
caveola 1 LIPE
extracellular exosome 3 FASN, GBA1, GLA
Lysosome membrane 1 GBA1
Lumenal side 2 GBA1, HSD17B6
endoplasmic reticulum 4 CYP19A1, GBA1, HSD17B6, SLC37A4
extracellular space 1 INS
lysosomal lumen 2 GBA1, GLA
perinuclear region of cytoplasm 1 EIF2AK2
mitochondrion 2 CYCS, OXSM
intracellular membrane-bounded organelle 1 HSD17B6
Microsome membrane 2 CYP19A1, HSD17B6
Secreted 1 INS
extracellular region 2 GLA, INS
mitochondrial matrix 1 OXSM
Cytoplasm, perinuclear region 1 EIF2AK2
Mitochondrion intermembrane space 1 CYCS
mitochondrial intermembrane space 1 CYCS
organelle membrane 1 SLC37A4
Endomembrane system 1 SLC37A4
endosome lumen 1 INS
Lipid droplet 1 LIPE
Membrane, caveola 1 LIPE
Melanosome 1 FASN
secretory granule lumen 1 INS
Golgi lumen 1 INS
endoplasmic reticulum lumen 1 INS
transport vesicle 1 INS
azurophil granule lumen 1 GLA
Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane 2 GLA, INS
apoptosome 1 CYCS
endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment 1 GLA
ribosome 1 EIF2AK2
glycogen granule 1 FASN


文献列表

  • Maoluo Gan, Bin Liu, Yi Tan, Qiang Wang, Hongxia Zhou, Hongwei He, Yuhui Ping, Zhaoyong Yang, Yiguang Wang, Chunling Xiao. Saccharothrixones A-D, Tetracenomycin-Type Polyketides from the Marine-Derived Actinomycete Saccharothrix sp. 10-10. Journal of natural products. 2015 Sep; 78(9):2260-5. doi: 10.1021/acs.jnatprod.5b00577. [PMID: 26317881]
  • M J Bibb, S Biró, H Motamedi, J F Collins, C R Hutchinson. Analysis of the nucleotide sequence of the Streptomyces glaucescens tcmI genes provides key information about the enzymology of polyketide antibiotic biosynthesis. The EMBO journal. 1989 Sep; 8(9):2727-36. doi: 10.1002/j.1460-2075.1989.tb08414.x. [PMID: 2684656]