Samidin (BioDeep_00000003786)

   

natural product PANOMIX_OTCML-2023


代谢物信息卡片


(+)-Samidin

化学式: C21H22O7 (386.1365)
中文名称: (+)-沙米丁
谱图信息: 最多检出来源 Viridiplantae(plant) 36.2%

分子结构信息

SMILES: CC(=CC(=O)OC1C(C2=C(C=CC3=C2OC(=O)C=C3)OC1(C)C)OC(=O)C)C
InChI: InChI=1S/C21H22O7/c1-11(2)10-16(24)27-20-19(25-12(3)22)17-14(28-21(20,4)5)8-6-13-7-9-15(23)26-18(13)17/h6-10,19-20H,1-5H3/t19-,20-/m1/s1

描述信息

同义名列表

3 个代谢物同义名

Samidin; (+)-Samidin; Samidin



数据库引用编号

36 个数据库交叉引用编号

分类词条

相关代谢途径

Reactome(0)

BioCyc(0)

PlantCyc(0)

代谢反应

0 个相关的代谢反应过程信息。

Reactome(0)

BioCyc(0)

WikiPathways(0)

Plant Reactome(0)

INOH(0)

PlantCyc(0)

COVID-19 Disease Map(0)

PathBank(0)

PharmGKB(0)

14 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有:

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息,我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表,这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序,取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘,得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序,取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中,存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称,可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 6 AIMP2, AKR1C3, MAPK8, PTGR2, PTGS2, TYR
Peripheral membrane protein 2 GORASP1, PTGS2
Endoplasmic reticulum membrane 1 PTGS2
Nucleus 4 AIMP2, AKR1C3, JUND, MAPK8
cytosol 3 AIMP2, AKR1C3, MAPK8
nucleoplasm 2 JUND, MAPK8
RNA polymerase II transcription regulator complex 1 JUND
Cell membrane 1 TNF
Cytoplasmic side 1 GORASP1
Golgi apparatus membrane 1 GORASP1
Synapse 1 MAPK8
cell surface 1 TNF
Golgi apparatus 1 GORASP1
Golgi membrane 1 GORASP1
neuronal cell body 1 TNF
Cytoplasm, cytosol 1 AIMP2
Lysosome 2 SGSH, TYR
plasma membrane 1 TNF
Membrane 1 AIMP2
axon 1 MAPK8
caveola 1 PTGS2
extracellular exosome 2 AKR1C3, SGSH
endoplasmic reticulum 1 PTGS2
extracellular space 1 TNF
lysosomal lumen 1 SGSH
perinuclear region of cytoplasm 1 TYR
protein-containing complex 1 PTGS2
intracellular membrane-bounded organelle 1 TYR
Microsome membrane 1 PTGS2
Single-pass type I membrane protein 1 TYR
extracellular region 1 TNF
transcription regulator complex 1 JUND
external side of plasma membrane 1 TNF
Melanosome membrane 1 TYR
Golgi-associated vesicle 1 TYR
recycling endosome 1 TNF
Single-pass type II membrane protein 1 TNF
Membrane raft 1 TNF
cis-Golgi network 1 GORASP1
Nucleus inner membrane 1 PTGS2
Nucleus outer membrane 1 PTGS2
nuclear inner membrane 1 PTGS2
nuclear outer membrane 1 PTGS2
neuron projection 1 PTGS2
chromatin 1 JUND
phagocytic cup 1 TNF
Melanosome 1 TYR
endoplasmic reticulum lumen 1 PTGS2
transcription repressor complex 1 JUND
Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane 1 GORASP1
Golgi apparatus, cis-Golgi network membrane 1 GORASP1
basal dendrite 1 MAPK8
aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex 1 AIMP2
transcription factor AP-1 complex 1 JUND
[Tumor necrosis factor, soluble form]: Secreted 1 TNF
[C-domain 2]: Secreted 1 TNF
[Tumor necrosis factor, membrane form]: Membrane 1 TNF
[C-domain 1]: Secreted 1 TNF


文献列表

  • Takahisa Suzuki, Atsushi Otsuka, Yoshihiko Ito, Shizuo Yamada, Hideaki Miyake, Seiichiro Ozono. Isosamidin, an extract of Peucedanum japonicum, inhibits phenylephrine-mediated contractions of the human prostate in vitro. Phytotherapy research : PTR. 2018 May; 32(5):949-952. doi: 10.1002/ptr.6039. [PMID: 29388272]