FA 12:3;O2 (BioDeep_00000629399)

 

Secondary id: BioDeep_00000003904


代谢物信息卡片


{(1R,2R)-2-[(2Z)-5-hydroxypent-2-en-1-yl]-3-oxocyclopentyl}acetic acid

化学式: C12H18O4 (226.1205)
中文名称:
谱图信息: 最多检出来源 Viridiplantae(plant) 12.13%

分子结构信息

SMILES: C(/C=C(\C)/CC/C=C(\C)/CCC(O)=O)(=O)O
InChI: InChI=1S/C12H18O4/c1-9(6-7-11(13)14)4-3-5-10(2)8-12(15)16/h4,8H,3,5-7H2,1-2H3,(H,13,14)(H,15,16)/b9-4+,10-8+



数据库引用编号

14 个数据库交叉引用编号

分类词条

相关代谢途径

Reactome(0)

BioCyc(0)

PlantCyc(0)

代谢反应

0 个相关的代谢反应过程信息。

Reactome(0)

BioCyc(0)

WikiPathways(0)

Plant Reactome(0)

INOH(0)

PlantCyc(0)

COVID-19 Disease Map(0)

PathBank(0)

PharmGKB(0)

3 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有:

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息,我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表,这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序,取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘,得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序,取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中,存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称,可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 4 AKR1B1, ARG1, SDF4, ZNF346
Peripheral membrane protein 1 CYP1B1
Endoplasmic reticulum membrane 1 CYP1B1
Nucleus 3 ARG1, MYB, ZNF346
cytosol 5 AKR1B1, ARG1, ENOX2, MYB, PAPSS2
nucleoplasm 3 AKR1B1, MYB, ZNF346
RNA polymerase II transcription regulator complex 1 MYB
Cell membrane 4 F11R, JAM2, JAM3, SDF4
Cytoplasmic granule 1 ARG1
cell junction 3 F11R, JAM2, JAM3
cell surface 1 JAM2
Golgi apparatus 2 JAM3, SDF4
plasma membrane 5 ENOX2, F11R, JAM2, JAM3, SDF4
Membrane 4 CYP1B1, JAM2, MYB, SDF4
extracellular exosome 3 AKR1B1, F11R, SDF4
endoplasmic reticulum 1 SDF4
extracellular space 3 AKR1B1, ARG1, JAM3
Cell junction, tight junction 3 F11R, JAM2, JAM3
bicellular tight junction 3 F11R, JAM2, JAM3
mitochondrion 2 AKR1B1, CYP1B1
protein-containing complex 1 F11R
intracellular membrane-bounded organelle 1 CYP1B1
Microsome membrane 1 CYP1B1
Single-pass type I membrane protein 3 F11R, JAM2, JAM3
extracellular region 2 ARG1, ENOX2
external side of plasma membrane 1 ENOX2
nucleolus 1 ZNF346
cell-cell junction 2 F11R, JAM3
Late endosome 1 SDF4
[Isoform 5]: Cytoplasm 1 SDF4
Nucleus, nucleolus 1 ZNF346
microvillus 1 JAM3
filamentous actin 1 JAM3
Golgi apparatus lumen 1 SDF4
Golgi lumen 1 SDF4
nuclear matrix 1 MYB
specific granule lumen 1 ARG1
Schmidt-Lanterman incisure 1 JAM3
tight junction 3 F11R, JAM2, JAM3
azurophil granule lumen 1 ARG1
paranodal junction 1 JAM3
somatodendritic compartment 1 JAM2
Cell junction, desmosome 1 JAM3
desmosome 1 JAM3
cell-cell contact zone 2 JAM2, JAM3
bleb 1 SDF4
protein complex involved in cell adhesion 2 JAM2, JAM3
[Isoform 1]: Golgi apparatus lumen 1 SDF4
[Soluble form of JAM-C]: Secreted 1 JAM3


文献列表