shikimate (BioDeep_00001894114)
natural product
代谢物信息卡片
化学式: C7H9O5 (173.0449964)
中文名称:
谱图信息:
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分子结构信息
SMILES: O=C(O)C1=CC(O)C(O)C(O)C1
InChI: InChI=1S/C7H10O5/c8-4-1-3(7(11)12)2-5(9)6(4)10/h1,4-6,8-10H,2H2,(H,11,12)/p-1/t4-,5-,6-/m1/s1
描述信息
A cyclohexenecarboxylate that is the conjugate base of shikimic acid.
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230 个相关的物种来源信息
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- 3702 - Arabidopsis thaliana: 10.4014/JMB.1312.12076
- 3702 - Arabidopsis thaliana: LTS0197942
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- 122625 - Blasia pusilla: LTS0197942
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- 29600 - Blechnaceae: LTS0197942
- 120712 - Brainea: LTS0197942
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- 120713 - Brainea insignis: LTS0197942
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- 3208 - Bryophyta: LTS0197942
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- 214223 - Callitris glaucophylla: 10.1016/S0031-9422(00)82391-2
- 214223 - Callitris glaucophylla: LTS0197942
- 703253 - Calophyllaceae: LTS0197942
- 73121 - Calophyllum: LTS0197942
- 280748 - Calophyllum brasiliense: 10.1016/J.LFS.2004.03.017
- 280748 - Calophyllum brasiliense: LTS0197942
- 114815 - Castanopsis: LTS0197942
- 167387 - Castanopsis fissa: 10.1016/J.PHYTOCHEM.2011.07.007
- 167387 - Castanopsis fissa: LTS0197942
- 16737 - Chloranthaceae: LTS0197942
- 289700 - Choerospondias: LTS0197942
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- 289701 - Choerospondias axillaris: LTS0197942
- 69450 - Cistaceae: LTS0197942
- 69451 - Cistus: LTS0197942
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- 393199 - Cistus incanus: LTS0197942
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- 34329 - Corymbia citriodora: LTS0197942
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- 155109 - Cyclopia subternata: LTS0197942
- 4038 - Daucus: LTS0197942
- 4039 - Daucus carota: 10.1104/PP.75.2.369
- 4039 - Daucus carota: LTS0197942
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- 37229 - Dicranopteris linearis: 10.1248/YAKUSHI1947.103.6_679
- 37229 - Dicranopteris linearis: LTS0197942
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- 561 - Escherichia: LTS0197942
- 562 - Escherichia coli: LTS0197942
- 2759 - Eukaryota: LTS0197942
- 3977 - Euphorbiaceae: LTS0197942
- 179681 - Excoecaria: LTS0197942
- 179682 - Excoecaria cochinchinensis: 10.1248/CPB.53.1600
- 179682 - Excoecaria cochinchinensis: LTS0197942
- 3803 - Fabaceae: LTS0197942
- 3503 - Fagaceae: LTS0197942
- 4751 - Fungi: LTS0197942
- 1236 - Gammaproteobacteria: LTS0197942
- 3310 - Ginkgo: LTS0197942
- 3311 - Ginkgo biloba: 10.1039/C1CC13306C
- 3311 - Ginkgo biloba: 10.1248/YAKUSHI1881.50.2_113
- 3311 - Ginkgo biloba: LTS0197942
- 3309 - Ginkgoaceae: LTS0197942
- 29811 - Ginkgoopsida: LTS0197942
- 3272 - Gleicheniaceae: LTS0197942
- 42216 - Hamamelidaceae: LTS0197942
- 13558 - Hedyosmum: LTS0197942
- 88917 - Hedyosmum bonplandianum: 10.1055/S-2006-959597
- 88917 - Hedyosmum bonplandianum: LTS0197942
- 23109 - Hydrangea: LTS0197942
- 498914 - Hydrangea chinensis: 10.1021/NP0302394
- 498914 - Hydrangea chinensis: LTS0197942
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- 629714 - Hypericaceae: LTS0197942
- 55962 - Hypericum: LTS0197942
- 268979 - Hypericum beanii: 10.1016/J.PHYTOCHEM.2006.09.037
- 268979 - Hypericum beanii: LTS0197942
- 1136989 - Hypericum laricifolium: 10.1248/CPB.51.1439
- 1136989 - Hypericum laricifolium: LTS0197942
- 684760 - Hypericum monogynum: 10.1201/9781420023305-8
- 684760 - Hypericum monogynum: LTS0197942
- 13097 - Illicium: LTS0197942
- 124794 - Illicium anisatum: 10.1016/0040-4020(96)00398-5
- 124794 - Illicium anisatum: LTS0197942
- 124775 - Illicium majus: 10.1248/CPB.39.1773
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- 124778 - Illicium verum: 10.1002/RECL.18860050905
- 124778 - Illicium verum: LTS0197942
- 186771 - Jungermanniopsida: LTS0197942
- 198771 - Kielmeyera: LTS0197942
- 2508380 - Kielmeyera pumila: 10.1016/0031-9422(88)80696-4
- 2508380 - Kielmeyera pumila: LTS0197942
- 254600 - Leptecophylla: LTS0197942
- 254603 - Leptecophylla juniperina: LTS0197942
- 254606 - Leptecophylla juniperina subsp. parvifolia: 10.1016/0031-9422(93)85522-S
- 254606 - Leptecophylla juniperina subsp. parvifolia: LTS0197942
- 13590 - Leucopogon: LTS0197942
- 142229 - Leucopogon parviflorus: 10.1016/0031-9422(93)85522-S
- 142229 - Leucopogon parviflorus: LTS0197942
- 4447 - Liliopsida: LTS0197942
- 4398 - Liquidambar: LTS0197942
- 4400 - Liquidambar styraciflua: 10.1016/J.TETLET.2008.02.140
- 4400 - Liquidambar styraciflua: LTS0197942
- 3402 - Magnolia: LTS0197942
- 85856 - Magnolia denudata: 10.1080/10286020108040371
- 85856 - Magnolia denudata: LTS0197942
- 3401 - Magnoliaceae: LTS0197942
- 3398 - Magnoliopsida: LTS0197942
- 3195 - Marchantiophyta: LTS0197942
- 186770 - Marchantiopsida: LTS0197942
- 2212703 - Mucoromycetes: LTS0197942
- 1913637 - Mucoromycota: LTS0197942
- 3931 - Myrtaceae: LTS0197942
- 316935 - Neoshirakia: LTS0197942
- 316936 - Neoshirakia japonica: 10.1248/CPB.14.877
- 316936 - Neoshirakia japonica: LTS0197942
- 5140 - Neurospora: LTS0197942
- 5141 - Neurospora crassa: LTS0197942
- 4747 - Orchidaceae: LTS0197942
- 4836 - Phycomyces: LTS0197942
- 4837 - Phycomyces blakesleeanus: LTS0197942
- 1344966 - Phycomycetaceae: LTS0197942
- 3318 - Pinaceae: LTS0197942
- 58019 - Pinopsida: LTS0197942
- 3337 - Pinus: LTS0197942
- 3339 - Pinus contorta: 10.1016/S0031-9422(00)86711-4
- 3339 - Pinus contorta: LTS0197942
- 71647 - Pinus pinaster: 10.1515/HF.1999.096
- 71647 - Pinus pinaster: LTS0197942
- 55062 - Pinus ponderosa: 10.1021/JF00110A049
- 55062 - Pinus ponderosa: LTS0197942
- 3349 - Pinus sylvestris: 10.1007/S10600-006-0229-9
- 3349 - Pinus sylvestris: LTS0197942
- 235790 - Piptostigma: LTS0197942
- 241806 - Polypodiopsida: LTS0197942
- 3689 - Populus: LTS0197942
- 77070 - Populus lasiocarpa: 10.1016/0031-9422(88)80758-1
- 77070 - Populus lasiocarpa: LTS0197942
- 3754 - Prunus: LTS0197942
- 3758 - Prunus domestica: 10.1021/JF0201327
- 3758 - Prunus domestica: LTS0197942
- 135621 - Pseudomonadaceae: LTS0197942
- 286 - Pseudomonas: LTS0197942
- 303 - Pseudomonas putida: LTS0197942
- 32100 - Pteridium: LTS0197942
- 32101 - Pteridium aquilinum: 10.1007/S11418-008-0225-4
- 32101 - Pteridium aquilinum: 10.1136/JECH.52.12.812
- 32101 - Pteridium aquilinum: LTS0197942
- 3511 - Quercus: LTS0197942
- 103488 - Quercus salicina: 10.1248/YAKUSHI1947.97.10_1131
- 103488 - Quercus salicina: LTS0197942
- 4012 - Rhus: LTS0197942
- 289753 - Rhus chinensis: 10.1248/CPB.14.877
- 289753 - Rhus chinensis: LTS0197942
- 3745 - Rosaceae: LTS0197942
- 24966 - Rubiaceae: LTS0197942
- 3688 - Salicaceae: LTS0197942
- 16733 - Schisandraceae: LTS0197942
- 99813 - Sequoiadendron: LTS0197942
- 99814 - Sequoiadendron giganteum: 10.1016/0031-9422(95)00450-L
- 99814 - Sequoiadendron giganteum: LTS0197942
- 5148 - Sordariaceae: LTS0197942
- 147550 - Sordariomycetes: LTS0197942
- 39238 - Stenostomum: LTS0197942
- 336032 - Stenostomum acreanum: 10.1055/S-2006-957449
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- 158529 - Sticherus: LTS0197942
- 1883 - Streptomyces: LTS0197942
- 1890 - Streptomyces antibioticus: LTS0197942
- 29301 - Streptomyces arenae: 10.1021/BI00608A017
- 29301 - Streptomyces arenae: 10.3389/FMICB.2018.01587
- 29301 - Streptomyces arenae: LTS0197942
- 42684 - Streptomyces collinus: LTS0197942
- 1915 - Streptomyces lincolnensis: 10.1002/MRC.2408
- 1915 - Streptomyces lincolnensis: LTS0197942
- 1827580 - Streptomyces nigra: 10.1021/BI00608A017
- 1827580 - Streptomyces nigra: 10.3389/FMICB.2018.01587
- 1827580 - Streptomyces nigra: LTS0197942
- 2062 - Streptomycetaceae: LTS0197942
- 35493 - Streptophyta: LTS0197942
- 508957 - Tara: LTS0197942
- 191904 - Tara spinosa: 10.1039/JR9610003786
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- 43852 - Toxicodendron: LTS0197942
- 269718 - Toxicodendron orientale: 10.1248/CPB.14.877
- 269718 - Toxicodendron orientale: LTS0197942
- 269721 - Toxicodendron succedaneum: 10.1248/CPB.14.877
- 269721 - Toxicodendron succedaneum: LTS0197942
- 269722 - Toxicodendron sylvestre: 10.1248/CPB.14.877
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- 269720 - Toxicodendron trichocarpum: 10.1248/CPB.14.877
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- 58023 - Tracheophyta: LTS0197942
- 316902 - Triadica: LTS0197942
- 139772 - Triadica sebifera: 10.1248/CPB.14.877
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- 13749 - Vaccinium: LTS0197942
- 174251 - Vaccinium dunalianum: 10.1016/J.PHYTOCHEM.2008.06.001
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- 13750 - Vaccinium macrocarpon: 10.1021/JF0205110
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- 180763 - Vaccinium myrtillus: 10.1021/JF0205110
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- 516948 - Vaccinium oxycoccos: 10.1021/JF0205110
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- 180772 - Vaccinium vitis-idaea: 10.1021/JF0205110
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- 33090 - Viridiplantae: LTS0197942
- 198794 - Vismia: LTS0197942
在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有:
- PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息,我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表,这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序,取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
- NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘,得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序,取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
- Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
- Chemical Reaction: 在化学反应过程中,存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。
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