Cladinose (BioDeep_00000008959)

 

Secondary id: BioDeep_00001870552


代谢物信息卡片


L-Cladinose

化学式: C8H16O4 (176.1049)
中文名称:
谱图信息: 最多检出来源 Astragalus membranaceus(plant) 33.33%

分子结构信息

SMILES: CC(C(C(C)(CC=O)OC)O)O
InChI: InChI=1S/C8H16O4/c1-6(10)7(11)8(2,12-3)4-5-9/h5-7,10-11H,4H2,1-3H3/t6-,7-,8+/m0/s1

描述信息

同义名列表

2 个代谢物同义名

L-Cladinose; Cladinose



数据库引用编号

8 个数据库交叉引用编号

分类词条

相关代谢途径

Reactome(0)

BioCyc(0)

PlantCyc(0)

代谢反应

0 个相关的代谢反应过程信息。

Reactome(0)

BioCyc(0)

WikiPathways(0)

Plant Reactome(0)

INOH(0)

PlantCyc(0)

COVID-19 Disease Map(0)

PathBank(0)

PharmGKB(0)

0 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有:

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息,我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表,这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序,取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘,得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序,取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中,存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称,可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 3 CYP3A4, FPR1, MEFV
Endoplasmic reticulum membrane 1 CYP3A4
Cytoplasmic vesicle, autophagosome 1 MEFV
Nucleus 1 MEFV
autophagosome 1 MEFV
cytosol 2 MEFV, MLNR
nucleoplasm 1 MEFV
Cell membrane 2 FPR1, TNF
lamellipodium 1 MEFV
Multi-pass membrane protein 1 FPR1
cell surface 1 TNF
Golgi apparatus 1 ATRN
neuronal cell body 1 TNF
plasma membrane 4 ATRN, FPR1, MLNR, TNF
Membrane 2 CYP3A4, FPR1
extracellular exosome 1 ATRN
extracellular space 5 ATRN, CXCL8, GNRH1, IL6, TNF
mitochondrion 1 BCO2
intracellular membrane-bounded organelle 1 CYP3A4
Microsome membrane 1 CYP3A4
Single-pass type I membrane protein 1 ATRN
Secreted 2 CXCL8, IL6
extracellular region 5 CXCL8, GNRH1, IL6, MLN, TNF
Single-pass membrane protein 1 MLN
[Isoform 2]: Secreted 1 ATRN
mitochondrial matrix 1 BCO2
external side of plasma membrane 1 TNF
cytoplasmic vesicle 1 MEFV
recycling endosome 1 TNF
Single-pass type II membrane protein 1 TNF
Cell projection, lamellipodium 1 MEFV
Membrane raft 1 TNF
microtubule 1 MEFV
Cell projection, ruffle 1 MEFV
ruffle 1 MEFV
microtubule associated complex 1 MEFV
phagocytic cup 1 TNF
[Isoform 3]: Secreted 1 ATRN
secretory granule membrane 1 FPR1
endoplasmic reticulum lumen 1 IL6
azurophil granule membrane 1 FPR1
Sarcoplasmic reticulum membrane 1 MLN
[Isoform 2]: Nucleus 1 MEFV
ficolin-1-rich granule membrane 1 FPR1
[Isoform 1]: Cytoplasm, cytoskeleton 1 MEFV
canonical inflammasome complex 1 MEFV
[Isoform 1]: Cell membrane 1 ATRN
[Tumor necrosis factor, soluble form]: Secreted 1 TNF
interleukin-6 receptor complex 1 IL6
[C-domain 2]: Secreted 1 TNF
[Tumor necrosis factor, membrane form]: Membrane 1 TNF
[C-domain 1]: Secreted 1 TNF


文献列表

  • K Kurihara, N Kikuchi, K Ajito. Cladinose analogues of sixteen-membered macrolide antibiotics. III. Efficient synthesis of 4-O-alkyl-L-cladinose analogues: improved antibacterial activities compatible with pharmacokinetics. The Journal of antibiotics. 1997 Jan; 50(1):32-44. doi: 10.7164/antibiotics.50.32. [PMID: 9066764]
  • K Kurihara, K Ajito, S Shibahara, T Ishizuka, O Hara, M Araake, S Omoto. Cladinose analogues of sixteen-membered macrolide antibiotics. I. Synthesis of 4-O-alkyl-L-cladinose analogues via glycosylation. The Journal of antibiotics. 1996 Jun; 49(6):582-92. doi: 10.7164/antibiotics.49.582. [PMID: 8698643]