Frangulin B (BioDeep_00000008037)

   

PANOMIX_OTCML-2023 natural product


代谢物信息卡片


Frangulin B

化学式: C20H18O9 (402.0951)
中文名称: 弗兰格林B, 泻鼠李皮苷B
谱图信息: 最多检出来源 Chinese Herbal Medicine(otcml) 92.11%

分子结构信息

SMILES: CC1=CC2=C(C(=C1)O)C(=O)C3=C(C2=O)C=C(C=C3O)OC4C(C(CO4)(CO)O)O
InChI: InChI=1S/C20H18O9/c1-8-2-10-14(12(22)3-8)17(25)15-11(16(10)24)4-9(5-13(15)23)29-19-18(26)20(27,6-21)7-28-19/h2-5,18-19,21-23,26-27H,6-7H2,1H3/t18-,19-,20+/m0/s1

描述信息

同义名列表

3 个代谢物同义名

Frangulin B; DB-042542; Frangulin B



数据库引用编号

16 个数据库交叉引用编号

分类词条

相关代谢途径

Reactome(0)

BioCyc(0)

PlantCyc(0)

代谢反应

0 个相关的代谢反应过程信息。

Reactome(0)

BioCyc(0)

WikiPathways(0)

Plant Reactome(0)

INOH(0)

PlantCyc(0)

COVID-19 Disease Map(0)

PathBank(0)

PharmGKB(0)

20 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有：

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息，我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表，这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序，取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘，得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序，取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中，存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称，可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 6 AKR1B1, AKR1C3, AKR7A2, AKR7A3, CBR1, FPR1
Nucleus 1 AKR1C3
cytosol 6 AKR1B1, AKR1B10, AKR1C3, AKR7A2, AKR7A3, CBR1
nucleoplasm 1 AKR1B1
Cell membrane 2 FPR1, TNF
Multi-pass membrane protein 1 FPR1
cell surface 2 ITGA2, TNF
Golgi apparatus 2 AKR7A2, AKR7A3
neuronal cell body 1 TNF
Lysosome 1 AKR1B10
plasma membrane 5 F2, FPR1, IFNLR1, ITGA2, TNF
Membrane 3 FPR1, IFNLR1, ITGA2
extracellular exosome 7 AKR1B1, AKR1C3, AKR7A2, AKR7A3, CBR1, F2, LYZ
extracellular space 4 AKR1B1, F2, LYZ, TNF
perinuclear region of cytoplasm 1 ITGA2
mitochondrion 3 AKR1B1, AKR1B10, AKR7A2
Single-pass type I membrane protein 2 IFNLR1, ITGA2
Secreted 2 AKR1B10, F2
extracellular region 4 AKR1B10, F2, LYZ, TNF
basal part of cell 1 ITGA2
external side of plasma membrane 2 ITGA2, TNF
Extracellular vesicle 1 CBR1
recycling endosome 1 TNF
Single-pass type II membrane protein 1 TNF
Membrane raft 1 TNF
focal adhesion 1 ITGA2
collagen-containing extracellular matrix 1 F2
phagocytic cup 1 TNF
blood microparticle 1 F2
secretory granule membrane 1 FPR1
Golgi lumen 1 F2
endoplasmic reticulum lumen 1 F2
axon terminus 1 ITGA2
specific granule lumen 1 LYZ
tertiary granule lumen 1 LYZ
azurophil granule membrane 1 FPR1
azurophil granule lumen 1 LYZ
ficolin-1-rich granule membrane 1 FPR1
integrin complex 1 ITGA2
[Tumor necrosis factor, soluble form]: Secreted 1 TNF
integrin alpha2-beta1 complex 1 ITGA2
interleukin-28 receptor complex 1 IFNLR1
[C-domain 2]: Secreted 1 TNF
[Tumor necrosis factor, membrane form]: Membrane 1 TNF
[C-domain 1]: Secreted 1 TNF


文献列表

  • Magdalena Westermann, Amma G Adomako-Bonsu, Solveig Thiele, Serhat Sezai Çiçek, Hans-Jörg Martin, Edmund Maser. Inhibition of human carbonyl reducing enzymes by plant anthrone and anthraquinone derivatives. Chemico-biological interactions. 2022 Feb; 354(?):109823. doi: 10.1016/j.cbi.2022.109823. [PMID: 35065925]
  • Immanuel Rosenthal, Evelyn Wolfram, Samuel Peter, Beat Meier. Validated method for the analysis of frangulins A and B and glucofrangulins A and B using HPLC and UHPLC. Journal of natural products. 2014 Mar; 77(3):489-96. doi: 10.1021/np400736s. [PMID: 24555690]
  • B L Wei, C M Lu, L T Tsao, J P Wang, C N Lin. In vitro anti-inflammatory effects of quercetin 3-O-methyl ether and other constituents from Rhamnus species. Planta medica. 2001 Nov; 67(8):745-7. doi: 10.1055/s-2001-18339. [PMID: 11731918]
  • C M Teng, C H Lin, C N Lin, M I Chung, T F Huang. Frangulin B, an antagonist of collagen-induced platelet aggregation and adhesion, isolated from Rhamnus formosana. Thrombosis and haemostasis. 1993 Dec; 70(6):1014-8. doi: . [PMID: 8165593]