Cyclic glycerate-2,3P2 (BioDeep_00000006083)

   


代谢物信息卡片


2,4-Dihydroxy-1,3,5,2,4-trioxadiphosphepane-7-carboxylic acid 2,4-dioxide

化学式: C3H6O9P2 (247.9487)
中文名称:
谱图信息: 最多检出来源 Homo sapiens(plant) 11.84%

分子结构信息

SMILES: C1C(OP(=O)(OP(=O)(O1)O)O)C(=O)O
InChI: InChI=1S/C3H6O9P2/c4-3(5)2-1-10-13(6,7)12-14(8,9)11-2/h2H,1H2,(H,4,5)(H,6,7)(H,8,9)



数据库引用编号

9 个数据库交叉引用编号

分类词条

相关代谢途径

Reactome(0)

BioCyc(0)

PlantCyc(0)

代谢反应

0 个相关的代谢反应过程信息。

Reactome(0)

BioCyc(0)

WikiPathways(0)

Plant Reactome(0)

INOH(0)

PlantCyc(0)

COVID-19 Disease Map(0)

PathBank(0)

PharmGKB(0)

1 个相关的物种来源信息

在这里通过桑基图来展示出与当前的这个代谢物在我们的BioDeep知识库中具有相关联信息的其他代谢物。在这里进行关联的信息来源主要有:

  • PubMed: 来源于PubMed文献库中的文献信息,我们通过自然语言数据挖掘得到的在同一篇文献中被同时提及的相关代谢物列表,这个列表按照代谢物同时出现的文献数量降序排序,取前10个代谢物作为相关研究中关联性很高的代谢物集合展示在桑基图中。
  • NCBI Taxonomy: 通过文献数据挖掘,得到的代谢物物种来源信息关联。这个关联信息同样按照出现的次数降序排序,取前10个代谢物作为高关联度的代谢物集合展示在桑吉图上。
  • Chemical Taxonomy: 在物质分类上处于同一个分类集合中的其他代谢物
  • Chemical Reaction: 在化学反应过程中,存在为当前代谢物相关联的生化反应过程中的反应底物或者反应产物的关联代谢物信息。

点击图上的相关代谢物的名称,可以跳转到相关代谢物的信息页面。

亚细胞结构定位 关联基因列表
Cytoplasm 3 BGLAP, ITPR3, VCL
Peripheral membrane protein 1 VCL
Endoplasmic reticulum membrane 2 ITPR3, LNPK
Nucleus 1 PRM1
cytosol 2 PRM1, VCL
dendrite 1 BGLAP
nucleoplasm 3 ITPR3, LNPK, PRM1
Cell membrane 1 VCL
Cytoplasmic side 2 LNPK, VCL
Multi-pass membrane protein 2 ITPR3, LNPK
neuronal cell body 1 ITPR3
sarcolemma 1 VCL
Lysosome 1 GALC
plasma membrane 3 ITPR3, TNFRSF11B, VCL
Membrane 2 ITPR3, LNPK
brush border 2 ITPR3, VCL
extracellular exosome 1 VCL
endoplasmic reticulum 2 ITPR3, LNPK
extracellular space 3 BGLAP, PTH, TNFRSF11B
lysosomal lumen 1 GALC
adherens junction 1 VCL
protein-containing complex 1 VCL
Secreted 2 BGLAP, TNFRSF11B
extracellular region 4 BGLAP, PTH, TNFRSF11B, VCL
Extracellular vesicle 1 VCL
perikaryon 1 BGLAP
nucleolus 1 ITPR3
apical part of cell 1 ITPR3
cell-cell junction 1 VCL
vesicle 1 BGLAP
Cell membrane, sarcolemma 1 VCL
Membrane raft 1 VCL
Cell junction, focal adhesion 1 VCL
Cytoplasm, cytoskeleton 1 VCL
focal adhesion 1 VCL
Cell junction, adherens junction 1 VCL
zonula adherens 1 VCL
extracellular matrix 1 TNFRSF11B
sarcoplasmic reticulum 1 ITPR3
fascia adherens 1 VCL
nuclear outer membrane 1 ITPR3
receptor complex 2 ITPR3, TNFRSF11B
cell projection 1 VCL
Chromosome 1 PRM1
cytoskeleton 1 VCL
Cell projection, podosome 1 VCL
podosome 1 VCL
ficolin-1-rich granule lumen 1 VCL
secretory granule lumen 1 VCL
secretory granule membrane 1 ITPR3
Golgi lumen 1 BGLAP
endoplasmic reticulum lumen 1 BGLAP
specific granule lumen 1 VCL
platelet dense tubular network membrane 1 ITPR3
costamere 1 VCL
nucleosome 1 PRM1
Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle membrane 1 ITPR3
cell-substrate junction 1 VCL
terminal web 1 VCL
cell-cell contact zone 1 VCL
transport vesicle membrane 1 ITPR3
cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane 1 ITPR3
inner dense plaque of desmosome 1 VCL
outer dense plaque of desmosome 1 VCL
podosome ring 1 VCL
endoplasmic reticulum tubular network 1 LNPK
endoplasmic reticulum tubular network membrane 1 LNPK


文献列表